Η Ιωάννα Λίλη έκανε μια αφιέρωση στον σύζυγό της, Θοδωρή Ζαγοράκη, σε μια σπάνια δημοσίευση. Η παρουσιάστρια ανάρτησε μια φωτογραφία τους, στην οποία είναι αγκαλιασμένοι και χαμογελούν ο ένας στον άλλο. Ο πρώην ποδοσφαιριστής έχει περάσει το χέρι του γύρω από τη μέση της συζύγου του, την ίδια ώρα που εκείνη του ακουμπάει με το χέρι της το πρόσωπο.
Στη λεζάντα της ανάρτησης, η Ιωάννα Λίλη έγραψε: «Μόνο η δική σου αγκαλιά».
Το ζευγάρι παντρεύτηκε τον Νοέμβριο του 2006, λίγο πριν από τη γέννηση του πρώτου τους παιδιού, στη Λυδία Καβάλας, γενέτειρα του Θοδωρή Ζαγοράκη, σε έναν από τους πιο πολυσυζητημένους αλλά και πιο «αθόρυβους» γάμους της χρονιάς. Το 2007 απέκτησαν την κόρη τους, Μαρία, ενώ τον Αύγουστο του 2010 ο Θοδωρής Ζαγοράκης και η Ιωάννα Λίλη έγιναν για δεύτερη φορά γονείς, αφού ήρθε στη ζωή ο γιος τους, Ιωάννης.
